Пакет autoconf как можно более новой версии необходим для новых версий пакета automake, а тот нужен для предотвращения лишних вил и граблей при компиляции программ. С древним autoconf в больших программах вылезают дикие ошибки. Но собрать этот пакет никак не удаётся.
Собрал, но для этого потребовалось переустановить всю систему по этой статье http://gis-lab.info/qa/postgis-wkt.html#mingw Очень жаль что нельзя скачивать одним куском уже настроенный эмулятор линукса со всеми необходимыми библиотеками.