Очень просто: выбрать в меню Options -> Open Global Options, появится вкладка "SCITEGlobal.properties", я просто заменил все, что там было (если вообще было, не помню) вот на это:
#using free pascal
# compile
command.compile.*.pas=fpc "$(FilePath)"
# normal execute
if PLAT_WIN
command.go.*.pas="$(FileName).exe"
command.go.subsystem.*.pas=2
if PLAT_GTK
command.go.*.pas="kvt -e $(FileName)"
# build
command.build.*.pas=fpc -B "$(FilePath)"
command.build.subsystem.*.pas=1
command.name.0.*.pas=Debug Compile
command.0.*.pas=fpc -g "$(FilePath)"
command.name.1.*.pas=Debug Build
command.1.*.pas=fpc -g -B "$(FilePath)"
command.name.2.*.pas=GDB
if PLAT_WIN
command.2.*.pas=gdbpasw "$(FileName)"
if PLAT_GTK
command.2.*.pas=gdb "$(FileName)"
command.name.3.*.pas=DDD
command.3.*.pas=ddd "$(FileName)"
, потом жмешь File -> Save... Все, эту вкладку можно закрывать...
И теперь при наборе твоей программы и сохранении ее в файл с расширением PAS тебе становятся доступны опции из меню Tools (Compile, Build и все остальные)... Вот так выглядит окно SciTE после компиляции программы, НЕ содержавшей ошибок:
А вот так - если ошибки были: