Есть сервис сервера FTP на базе компонента IdFTPServer, как можно сделать или с помощью чего можно сделать панель упраления этим сервером

Поищи в DRKB->Системные функции и WinAPI->Сервисы NT и драйверы, функции специфичные для XP->Написание сервисов Windows NT на WinAPI.