КТо может обьяснить , как составлять с помощью этой утилиты блок=схемы

Когда выберешь режим, перед тобой будет панелька с блоками... Выбираешь нужные, размещаешь на листе. А потом соединяешь.

они почему то какие то трехмерные... при распечатке будут выглядеть нормально ?

нет... они будут такие же как и в редакторе.. юзай Word ;)

Скорее всего ты выбираешь не те элементы.
Закрашенные,цветные или трехмерные блок схемы используют обычно для отличия алгоритмов от деловых процессов.