То, что делается в консоли Code::Blocks:
"Process returned 0 (0x0) execution time : 0.780 s
Press any key to continue."
- никак.
В предыдущих версиях Eclipse (до Helios включительно) для контроля за временем исполнения (и общего для программы, и по каждой отдельной функции) предназначался плагин
TPTP. С последней версией (Eclipse Indigo) он не работает. Так что либо откатываться на Helios и использовать плагин, либо добавлять к программе код, вычисляющий время ее выполнения.