Что то никак не могу сформулировать алгоритм.

В файле целого типа расставить в обратном порядке все значения кратные 3.

звучит просто но не могу понять, как?

нужен только алгоритм, но если кто напишет прогу буду сильно благодарен.

то есть
было 12 7 14 -6 9 15 0 7 13
стало 0 7 14 15 9 -6 12 7 13

Заводишь переменную x, которая будет проходить по числам, кратным 3, в обратном порядке. В начале х = n, т.е. указывает на последний элемент массива.

Идешь циклом от 1 до n, формируя новый массив. Если число не кратно 3, просто копируешь. Каждый раз, когда встречаешь кратное 3 - двигаешь х влево до тех пор, пока не встретишь первое кратное трем, и пишешь его вместо текущего:

begin
  x := n;
  for i := 1 to n 
    if a[i] mod 3 <> 0 then
      b[i] := a[i];
    else begin
      while x mod 3 <> 0 do
        Dec(x);
      b[i] := a[x]; 
      Dec(x); //сместили еще на 1 влево, чтобы в следующий раз искать дальше, а не остановится навсегда в этом месте
    end;
end;

Если надо, копируешь потом массив b обратно в a.

можно без массива сделать, вот программа, потестировал, сбоев не было.

uses crt;

var
  f, tmp: file of Integer;
  i, n, value, right, rValue: Integer;

begin
  clrscr;

  randomize;

  n := random(10);

  assign(f, 'c:\file.int');
  rewrite(f);

  for i := 1 to n do begin
     value := random(10);
     write(f, value);
     writeln(value);
  end;

  reset(f);

  assign(tmp, 'c:\tmp.int');
  rewrite(tmp);

  right := filesize(f);

  writeln;

  for i := 0 to filesize(f) - 1 do begin

    seek(f, i);
    read(f, value);

    if (not odd(value)) or (i = right - 1) then begin
      seek(tmp, i);
      write(tmp, value);
    end else if i < right then begin

      repeat
        dec(right);
        seek(f, right);
        read(f, rValue);
      until odd(rValue);

      seek(tmp, i);
      write(tmp, rValue);

      seek(tmp, right);
      write(tmp, value);
    end;

  end;

  close(f);
  erase(f);

  close(tmp);
  rename(tmp, 'c:\file.int');

  reset(tmp);

  writeln;

  while not eof(tmp) do begin
    read(tmp, value);
    writeln(value);
  end;

  close(tmp);

  readln;
end.

Добавлено через 13 мин.
тока перепутал мальца, вместо not odd(value) надо not (value mod 3 = 0)